德国境内河流很多，主要河流有莱因河、易北河、奥得河、多瑙河、威悉河和埃姆斯河；它们的主要支流有美因河、内卡河、摩泽尔河和鲁尔河，等等。
莱因河是西欧大的河流，全长l320公里。它发源于瑞士中南部的阿尔卑斯山脉北麓，从南向北流经瑞士、列支敦士登、奥地利、德国、法国和荷兰6个国家，在荷兰鹿特丹港附近注入北海。莱因河河面宽阔，从瑞士的巴塞尔港到荷兰的鹿特丹港，全程畅通无阻，是西欧各国南来北往的通航大道。
在德国境内的莱因河长约867公里，是德国大的河流。它的支流很多，流域面积为107，000平方公里。德国的北莱因一威斯特伐利亚、黑森、莱因兰一法耳茨、萨尔和巴登一符腾堡5个州，均分布在莱因河流域地区。这里既是德国工业的发源地，也是德国工业的主要基地。号称“德国工业心脏”的鲁尔区，德国第二重要工业基地萨尔区，都集中在这里。
易北河全长1165公里，发源于捷克境内，由东南流向西北，经德国北部平原注入北海。
在德国境内的易北河，全长约700公里，是东部地区大的河流。它左岸的重要支流是萨勒河，右岸的重要支流为哈弗尔河，它们由一系列运河连接起来，形成了四通八达的内河网，如柏林西部的哈弗尔一易北河运河，沟通了柏林与易北河之间的水路交通，使柏林的船只可以通航到汉堡等港口。
奥得河全长900公里，上游在波兰境内，下游是德国与波兰之间的分界河。施普雷一奥得河运河把柏林与奥得河连接起来，使柏林的船只可以通航到波兰和波罗的海沿岸港口。
易北河、奥得河和连接这两条河流的东、西运河体系，总共有2，538公里的水路，在内河航运上具有重要价值。
威悉河全长约500公里，由南向北流经不来梅附近注入北海。
多瑙河是一条国际性的河流，全长2850公里，是欧洲第二条大河。它发源于阿尔卑斯山北坡，向东流经德国南部地区，出德国经奥地利、斯洛伐克、匈牙利、塞尔维亚、保加利亚、罗马尼亚和乌克兰，后流入黑海。
德国境内河流多，运河也不少，其中重要的是基尔运河和中德运河。
基尔运河建于1887—1894年，全长100公里，宽103米，横穿石勒苏益恪一荷尔斯泰因州，连接易北河河口和基尔港，是波罗的海和北海之间的航运捷径，可通航2.5万吨级货轮和3.5万吨级客轮。中德运河把莱因河、易北河、威悉河和奥得河连接起来，不仅使德国境内的水路四通八达，形成稠密的内河航道，而且可以通航到荷兰、法国、瑞士和波兰等国家。